Mannen var anställd på företaget i Lidköping i åtta år och stod bland annat i kassan.
Enligt åklagaren har han tagit kontanter ur kassan genom att göra falska returköp på sammanlagt 1,1 miljoner kronor.
– Brottet är grovt då han försökt dölja sina returköp genom att använda sig av sina medarbetares inloggningsuppgifter, skriver åklagaren.
Under tiden augusti 2010 till maj 2013 ska den anställde vid 105 tillfällen ha sålt varor från butiken på Tradera och Blocket för 550 000 kronor.
37-åringen är även misstänkt för trolöshet mot huvudman sedan han ska ha fört över cirka 45 000 kronor till sitt eget konto från den förening där han var kassör.
Det var mannens arbetsgivare som polisanmälde honom efter att hon upptäckt underliga returköp och att han sålt varor som liknade butikens på nätet.
